由于MBR膜堆在膜池中不断曝气冲刷，如不进行有效的固定方式膜架会在膜池中左右摆动甚至侧翻在膜池中。

工程中常用的固定方式为轨道固定，在膜堆机架的对向两侧焊接卡槽，在膜池中相应的两侧池壁滑轨安装固定，安装膜堆时将膜堆机架上卡槽卡入膜池中的滑轨后将膜堆放入。

轨道固定不仅可以防止膜架在膜池中侧翻在需要将膜架吊出时如看不到水面下膜架的吊钩，可以将膜堆曝气开大，这时膜堆整体就会沿着轨道垂直向上的方向上浮，就可找到吊钩。